K používání a měření webu využíváme cookies. Používáním tohoto webu souhlasíte se způsobem, jakým s cookies nakládáme. Další informace

Pracovní stanice a software pro analýzu obrazu

Klient: CEITEC CELLIM Pracovní stanice a software pro analýzu obrazu

Vybavení servisní laboratoře Buněčného zobrazování - CELLIM na brněnském CEITECu se rozšířilo o plnou verzi softwaru Imaris – Single Full pro 3D vizualizace a analýzu obrazových dat z mikroskopu. Pro uživatele mikroskopů je to rozšíření dosavadních možností analýzy obrazových dat v široké škále oblastí od buněčné biologie, přes embryologii až po neurologii a tkáňový výzkum. Licence je provozována na dedikované pracovní stanici Mac Pro s parametry přizpůsobenými analýze a vizualizace objemných dat.

Popis nového zařízení:


Plná licence softwaru Imaris – Single Full sestává z těchto modulů:
  • Core – 3D/4D vizualizace, Snapshots, Videa
  • MeasurementPro - Statistické údaje, Měření tvarů a intenzity ve 3D/4D, Interaktivní uspořádání a klasifikace
  • Vantage - Grafické zobrazení dat – 1D/2D/3D/4D, Srovnání dvou a více skupin dat, Statistické výpočty, rozpoznání trendů a odchylek
  • Batch - vytvoření univerzálního protokolu pro hromadnou analýzu, Aplikace protokolu na různé obrazové datové sady zároveň, Možnost srovnání statistických údajů v modulu Vantage
  • Coloc - Míra kolokalizace, Výběr různých kolokalizačních metod, Analýza ve 3D/4D
  • XT - Kompatibilita s Matlab/Java/Python, Veřejná internetová platforma pro sdílení uživatelských rozšíření – Imaris Open
  • Cell - Vztahy mezi buňkami a jejich organelami, Měření mechanických a strukturálních buněčných funkcí, Intuitivní jednotky na bázi buněčné morfologie (jádra, vezikuly, membrány)
  • TrackLineage - Trasování objektů 2D/3D/4D (3D tracking), Automatická detekce buněčného dělení, Stopování buněčných linií
  • FilamentTracer - Detekce a sledování filamentárních struktur (dendrity, cytoskelet, kanalikuly,...), Algoritmy pro automatickou analýzu, Možnost manuálního zpracování či manuální finální úpravy

Komponenty:

Licence Imaris Single Full

Pracovní stanice Mac Pro
  • procesor: 2.7 GHz 12 core Intel Xeon E5
  • paměť: 64 GB DDR3 RAM
  • grafická karta: AMD FirePro D7000 6 GB
  • OS: MacOS High Sierra

Imaris

Imaris

Software pro 3D vizualizaci a intuitivní analýzu objemných obrazových dat