Pracovní stanice a software pro analýzu obrazu

Vybavení servisní laboratoře Buněčného zobrazování - CELLIM na brněnském CEITECu se rozšířilo o plnou verzi softwaru Imaris – Single Full pro 3D vizualizace a analýzu obrazových dat z mikroskopu. Pro uživatele mikroskopů je to rozšíření dosavadních možností analýzy obrazových dat v široké škále oblastí od buněčné biologie, přes embryologii až po neurologii a tkáňový výzkum. Licence je provozována na dedikované pracovní stanici Mac Pro s parametry přizpůsobenými analýze a vizualizace objemných dat.

Popis nového zařízení:

Plná licence softwaru Imaris – Single Full sestává z těchto modulů:

• Core – 3D/4D vizualizace, Snapshots, Videa
• MeasurementPro - Statistické údaje, Měření tvarů a intenzity ve 3D/4D, Interaktivní uspořádání a klasifikace
• Vantage - Grafické zobrazení dat – 1D/2D/3D/4D, Srovnání dvou a více skupin dat, Statistické výpočty, rozpoznání trendů a odchylek
• Batch - vytvoření univerzálního protokolu pro hromadnou analýzu, Aplikace protokolu na různé obrazové datové sady zároveň, Možnost srovnání statistických údajů v modulu Vantage
• Coloc - Míra kolokalizace, Výběr různých kolokalizačních metod, Analýza ve 3D/4D
• XT - Kompatibilita s Matlab/Java/Python, Veřejná internetová platforma pro sdílení uživatelských rozšíření – Imaris Open
• Cell - Vztahy mezi buňkami a jejich organelami, Měření mechanických a strukturálních buněčných funkcí, Intuitivní jednotky na bázi buněčné morfologie (jádra, vezikuly, membrány)
• TrackLineage - Trasování objektů 2D/3D/4D (3D tracking), Automatická detekce buněčného dělení, Stopování buněčných linií
• FilamentTracer - Detekce a sledování filamentárních struktur (dendrity, cytoskelet, kanalikuly,...), Algoritmy pro automatickou analýzu, Možnost manuálního zpracování či manuální finální úpravy

Komponenty:

Licence Imaris Single Full

Pracovní stanice Mac Pro

• procesor: 2.7 GHz 12 core Intel Xeon E5
• paměť: 64 GB DDR3 RAM
• grafická karta: AMD FirePro D7000 6 GB
• OS: MacOS High Sierra

---

Související produkty

Další fotografie