Nová verze softwaru pro analýzu obrazových dat - Imaris 9.3.0
Společnost Bitplane začátkem tohoto měsíce spustila novou verzi analytického software Imaris 9.3.0, která sebou přináší hned několik novinek zajišťujících svým uživatelům „hladší pracovní postup“ při vizualizaci mikroskopických dat a jejich pokročilé analýze.
Jednou z novinek je vylepšení strukturované databáze pro organizaci dat (Arena) tak, aby fungovala jako prohlížeč mikroskopických snímků a umožnila:
- vizualizaci miniatur veškerých dat najednou (one view)
- jednoduchou konverzi všech typů souborů do Imarisem podporovaného formátu .ims a jejich organizaci na jednom místě (one place)
- provedení více kroků zpracování obrazu, dekonvoluci a veškerou analýzu dat najednou (one pipeline).
Nová Arena dokáže zobrazit vlastnosti dat i procesy aplikované na snímek při jeho zpracování, umožňuje odebrání a opětovné vložení vybraných souborů z databáze nebo úplné vymazání z disku.
Další novinkou verze Imaris 9.3.0 je integrace ClearView™ GPU dekonvolučních algoritmů pro spinning disk konfokální mikroskopii, widefield fluorescenci, brightfield mikroskopii, laserovou skenovací konfokální mikroskopii a TIRF. Tyto algoritmy jsou navrženy pro grafické karty NVIDIA a AMD, podporovány jsou jak operačním systémem Windows, tak i MacOS.
Poslední novinkou je funkce „Image Processing“ umožňující náhled na snímek před jeho kompletním zpracováním. Dalšími výhodami této funkce je:
- možnost upravit velikost náhledu na objekt tak, aby bylo co nejlépe vidět jeho detaily
- zobrazení snímku ve „Volume“ nebo „Slice View“ módu a rychlé přepínání mezi nimi
- možnost definovat příkaz zpracování obrazu (např. Gaussův filtr, Gamma korekce, dekonvoluce a další) pro každý kanál zvlášť nebo ho zkopírovat a aplikovat do více kanálů
- možnost zkombinovat více operací pro zpracování obrazu do jednoho protokolu a vytvořit tzv. „batch processing pipeline“ – ten poté lze aplikovat na vybrané snímky
Klíčové vlastnosti nové verze Imaris 9.3.0
- one view – vizualizace miniatur všech dat najednou
- one place – konverze souborů a organizace dat na jednom místě
- one pipeline – více procesů zpracování obrazu v jednom kroku
- integrace nových ClearView™ GPU dekonvolučních algoritmů
Dokumenty
