Das Unternehmen Bitplane hat Anfang dieses Monats eine neue Version der Analysesoftware Imaris 9.3.0 veröffentlicht, die gleich mehrere Neuerungen mit sich bringt, die den Anwendern einen „reibungsloseren Arbeitsablauf“ bei der Visualisierung mikroskopischer Daten und deren fortgeschrittener Analyse gewährleisten.
Eine der Neuerungen ist die Verbesserung der strukturierten Datenbank zur Datenorganisation (Arena), sodass sie nun als Viewer für mikroskopische Aufnahmen fungiert und Folgendes ermöglicht:
- die Visualisierung von Miniaturansichten aller Daten auf einen Blick (one view)
- die einfache Konvertierung aller Dateitypen in das von Imaris unterstützte .ims-Formatund deren Organisation an einem Ort (one place)
- die Durchführung mehrerer Bildverarbeitungsschritte, der Dekonvolution und der gesamten Datenanalyse in einem Durchgang (one pipeline).
Die neue Arena kann sowohl die Eigenschaften der Daten als auch die bei der Bildverarbeitung angewandten Prozesse anzeigen und ermöglicht das Entfernen und erneute Einfügen ausgewählter Dateien aus der Datenbank oder deren vollständige Löschung von der Festplatte.
Eine weitere Neuerung der Version Imaris 9.3.0ist die Integration der ClearView™-GPU-Dekonvolutionsalgorithmen für Spinning-Disk-Konfokalmikroskopie, Weitfeld-Fluoreszenz, Hellfeldmikroskopie, Laser-Scanning-Konfokalmikroskopie und TIRF. Diese Algorithmen sind für Grafikkarten von NVIDIA und AMD ausgelegt und werden sowohl von Windows als auch von macOS unterstützt .
Die neueste Neuerung ist die Funktion„Image Processing“, die eine Vorschau des Bildes vor dessen vollständiger Verarbeitung ermöglicht. Weitere Vorteile dieser Funktion sind:
- die Möglichkeit, die Größe der Objektvorschau so anzupassen, dass dessen Details bestmöglich sichtbar sind
- die Anzeige des Bildes im „Volume“-oder„Slice View“-Modus sowie das schnelle Umschalten zwischen diesen Modi
- die Möglichkeit, einen Bildverarbeitungsbefehl (z. B. Gauß-Filter, Gammakorrektur, Dekonvolution und andere) für jeden Kanal separat zu definieren oder ihn zu kopieren und auf mehrere Kanäle anzuwenden
- Möglichkeit, mehrere Bildverarbeitungsoperationen zu einem Protokoll zu kombinieren undeinesogenannte„Batch-Verarbeitungspipeline“zu erstellen – diese kann dann auf ausgewählte Bilder angewendet werden
Wichtigste Funktionen der neuen Version Imaris 9.3.0
- „One View“ – Visualisierung aller Daten als Miniaturansichten auf einen Blick
- „One Place“ – Dateikonvertierung und Datenorganisation an einem Ort
- One Pipeline – mehrere Bildverarbeitungsprozesse in einem Schritt
- Integration neuer ClearView™-GPU-Dekonvolutionsalgorithmen