Die Ausstattung des Servicelaborsfür Zellbildgebung – CELLIM im CEITEC in Brünn wurde um die Vollversion der SoftwareImaris – Single Full für die 3D-Visualisierung und Analyse von Bilddaten aus dem Mikroskop erweitert. Für Mikroskopbenutzer bedeutet dies eine Erweiterung der bisherigen Möglichkeiten zur Analyse von Bilddaten in einer Vielzahl von Bereichen, von der Zellbiologie über die Embryologie bis hin zur Neurologie und Gewebeforschung. Die Lizenz wird auf einer dedizierten Mac Pro-Workstation betrieben, deren Parameter speziell auf die Analyse und Visualisierung umfangreicher Datenmengen abgestimmt sind.
Beschreibung der neuen Anlage:
Die Volllizenz der Software Imaris – Single Fullumfasst folgende Module:
- Core – 3D/4D-Visualisierung, Schnappschüsse, Videos
- MeasurementPro – Statistische Daten, Form- und Intensitätsmessungen in 3D/4D, interaktive Anordnung und Klassifizierung
- Vantage – Grafische Darstellung von Daten – 1D/2D/3D/4D, Vergleich von zwei oder mehr Datengruppen, statistische Berechnungen, Erkennung von Trends und Abweichungen
- Batch – Erstellung eines universellen Protokolls für die Massenanalyse, Anwendung des Protokolls auf verschiedene Bilddatensätze gleichzeitig, Möglichkeit zum Vergleich statistischer Daten im Vantage-Modul
- Coloc – Kolokalisierungsgrad, Auswahl verschiedener Kolokalisierungsmethoden, Analyse in 3D/4D
- XT – Kompatibilität mit Matlab/Java/Python, öffentliche Internetplattform zum Austausch von Benutzererweiterungen – Imaris Open
- Cell – Beziehungen zwischen Zellen und ihren Organellen, Messung mechanischer und struktureller Zellfunktionen, intuitive Einheiten auf Basis der Zellmorphologie (Kern, Vesikel, Membranen)
- TrackLineage – Verfolgung von Objekten in 2D/3D/4D (3D-Tracking), automatische Erkennung der Zellteilung, Verfolgung von Zelllinien
- FilamentTracer – Erkennung und Verfolgung filamentärer Strukturen (Dendriten, Zytoskelett, Kanälchen, ...), Algorithmen zur automatischen Analyse, Möglichkeit der manuellen Bearbeitung oder manuellen Endbearbeitung
Komponenten:
- Mac Pro-Workstation
- Imaris Single Full-Lizenz
- Prozessor: 2,7 GHz 12-Kern-Intel-Xeon-E5
- Arbeitsspeicher: 64 GB DDR3-RAM
- Grafikkarte: AMD FirePro D7000 6 GB
- Betriebssystem: macOS High Sierra
