Analýza filament - 3D morfologie neuronů
Anatomie neuronální sítě umožňuje správné fungování mozku. Konfokální mikroskopie a následná analýza nasnímaných dat je cesta k poznání anatomie a fyziologie neuronových oběhů a vztahů v rámci neuronových sítí. Neurony jakožto specifické filamentární struktury lze analyzovat pomocí specializovaných softwarových nástrojů manuálně anebo automaticky.
Matthias G. Haberl a kolegové se touto problematikou zabývají a vyvinuli nový postup pro fluorescenční značení a automatickou analýzu objemných dat z mikroskopu.
Neurony jsou označeny virovým vektorem, který se v buňkách exprimuje jako intenzivní fluorescenční protein, ten poté vyplní veškeré neuronové výběžky včetně velmi dlouhých axonů. Takto připravené vzorky jsou snímány pomocí konfokálního mikroskopu a posléze analyzovány. Pomocí dedikovaného softwaru je vytvořen 3D model celých dendritů, dendritických trnů a synapsí. Tyto modely jsou posléze použity pro kvantifikaci klíčových anatomických parametrů.
Oproti většině konvenčním přístupům, lze pomocí "Haberlovy metody" studovat neurony fyziologicky starších modelových organismů. To umožnilo vědcům rekonstruovat jemné morfologické detaily myšího mozku staršího jedince s indukovanou Alzheimerovou chorobou. Tato metoda přináší nové možnosti výzkumu této rozšířené neurodegenerativní nemoci.
Software Imaris s modulem FilamentTracer nabízí velice intuitivní a flexibilní nastavení pro analýzu filamentárních struktur (neurony, filamentární proteiny, cévy):
- 3D vizualizace a analýza filament
- Detekce a sledování filamentárních struktur
- Algoritmy pro automatickou analýzu
- Možnost manuálního zpracování či manuální finální úpravy
Webinář
Introduction To Imaris For Neuroscientists - Imaris 8.4
