Dekonvoluce – PSF a algoritmy
Dekonvoluce (deconvolution) v mikroskopii je rozšířená metoda pro zpracování obrazových dat. Mikroskop vnáší při zobrazování do získaných dat určitou vadu (PSF – konvoluce). Dekonvoluční algoritmy pracují s jejími parametry a korigují výstupní data pro zisk obrazu s vyšším rozlišením, který lépe reprezentuje zkoumaný objekt.
Rozptylová funkce (PSF – point spread function) znázorňuje získanou informaci z mikroskopu při zobrazování objektu ve formě bodu (point source). Velikost a tvar PSF závisí na parametrech komponent, kterými prochází signál, na indexech lomu (n) všech prostředí a také na použité metodě (viz Obrázek 1.)
Existuje mnoho různých dekonvolučních algoritmů, které se aplikují na data z mikroskopů (viz tabulka). Všechny pracují s obrazem po konvoluci a jejich výstupem je více či méně kvalitní reprodukce reálného objektu.
Algoritmy „No/Nearest – neighbor“ jsou poměrně jednoduché a podobně jako u konfokální mikroskopie odstraňují signál mimo rovinu zaostření. Ostatní uvedené algoritmy jsou již složitější a především ty iterativní (Non-blind/Blind constrained iterative) využívají všechen získaný signál pro výslednou podobu obrazu.
Software pro dekonvoluci AutoQuant (Bitplane) má tyto parametry:
- Flexibilita výběru různých algoritmů pro konkrétní aplikaci
- Velmi sofistikované algoritmy pro tzv. „slepou dekonvoluci“ (blind deconvolution)
- Intuitivní a přímočarý postup s automatickou kontrolou přesnosti metadat
- Kompatibilní s více než 20 formáty z akvizičních a analytických softwarů
- Přímé propojení se softwarem Imaris pro analýzu obrazu
- Online podpora, tutoriály a webináře, návody na konkrétní aplikace
Webinář
Produkty pro Dekonvoluce – PSF a algoritmy
Konfokální mikroskop Dragonfly 200
Flexibilní multimodální platforma, která v jednom systému nabízí spinning disk konfokálního snímání, laserové widefield zobrazování, zobrazování v procházejícím světle a SRRF-Stream+.
Kompaktní konfokální mikroskop Andor BC43 CF
Rychlá a snadná konfokální mikroskopie v jakékoli laboratoři
Konfokální mikroskop Dragonfly 600
Plně nakonfigurovaný systém Dragonfly s 3D SMLM modulem pro widefield a konfokální zobrazování a s patentovaným modulem B-TIRF (pro DNA-PAINT, dSTORM a PALM)
Konfokální mikroskop Dragonfly 400
Multimodální spinning disk konfokální systém s možností 3D SMLM (DNA-PAINT)
Kompaktní fluorescenční mikroskop Andor BC43 WF
Nový přírůstek do řady stolních mikroskopů, ideální pro rutinní widefield zobrazování s velkým potenciálem růstu!