Kolokalizační studie – virové receptory
Konfokální mikroskopie umožňuje rychlé a velice kvalitní snímání ve vysokém rozlišení. Získaná data ve formě optických řezů je nutné rekonstruovat a následně analyzovat. Kolokalizační studie (3D colocalization) je spolehlivá metoda, která odhalí strukturní vztahy mezi zobrazovanými objekty.
V laboratoři Dr. Xaviera Forns (IDIBAPS&NIH) se věnují výzkumu kinetiky viru Hepatitis C pro lepší porozumění průběhu opakované infekce tímto virem po transplantaci jater. Hlavním bodem zájmu bylo porovnání exprese receptoru viru Hepatitis C s celkovou kinetikou infekce.
Tato studie společně s dalšími výsledky ukázala, že množství receptoru viru Hepatitis C v čase transplantace jater reguluje počáteční kinetiku viru. Opakovaná infekce virem Hepatitis C po transplantaci je přímo spojena s množstvím těsných spojů v membránách jaterních buněk.
Software Imaris s modulem Coloc nabízí velice intuitivní a flexibilní nastavení pro kolokalizační analýzu (3D colocalization):
- Manuální nebo automatické nastavení práhu citlivosti (threshold)
- Intuitivní 2D histogram s intenzitami všech voxelů
- Statistické údaje v reálném čase (Pearson, Mander, % volume/ROI)
- Kolokalizační studie snímků dynamických událostí (timelapse)
- Vytvoření nového kanálu pro prezentaci dat
Podrobnější informace o kolokalizačních algoritmech, které jsou použity v modulu Coloc najdete ve vědeckém článku – Costes et al., „Automatic and Quantitative Measurement of Protein-Protein Colocalization in Live Cells.“
Webináře
Produkty pro Kolokalizační studie – virové receptory
Konfokální mikroskop Dragonfly 600
Plně nakonfigurovaný systém Dragonfly s 3D SMLM modulem pro widefield a konfokální zobrazování a s patentovaným modulem B-TIRF (pro DNA-PAINT, dSTORM a PALM)
Konfokální mikroskop Dragonfly 400
Multimodální spinning disk konfokální systém s možností 3D SMLM (DNA-PAINT)